Gdy miasto było w rękach Pradawnych, a później ludzi z genem, Wraith napewno niejednokrotnie próbowali je zdobyć ( w odcinku jem mowa o kilkuset latach nieobecności Wraith, a od odejścia Pradawnych minęło 10 tys. lat)
Jak sam piszesz: "kilkuset lat nieobecności Wraith" a to oznacza prawie 9 500 lat obecności.
To miasto (albo lepiej - ta planeta) była zdobyta przez Wraith i prawdopodobnie była ich żerowiskiem.
Poniewaz nikt nie aktywował technologii Pradawnych Wraith nawet jeje nie poszukiwało. Więc Drugie miasto "zarastało trawą".
Prawdopodobnie kilkaset lat temu jakiś człowiek "znalazł" wieże i usiadł na tronie - okazało się, że tron na niego zareagował i tak mamy Lorda Protektora. Od tego czasu wszystkie darty, które przybywały na ta planetę nie wracały do roju (jak pamiętamy hiveshipy wylądowały i Wraith hibernują a na wyprawy wyruszają jedynie Darty z członkami nielicznej ochrony, która nie śpi.)
Więc nie musiało być tak jak piszesz. Mogło nie być wielkich bitew i oblężenia itp. itd.